Ústav chemie a technologie sacharidů v celé své historii rozsáhle spolupracoval – i nyní spolupracuje – s výzkumnými pracovišti a podniky v oblasti průmyslu cukrovarnického, pekárenského, mlýnského, cukrovinkářského, trvanlivého pečiva, těstovin, škrobárenského a výroby krmiv. Spolupracuje i na problémech kvality surovin rostlinného původu v oblasti pěstitelské a v oblasti dodavatelských podniků.